В последние дни Второй мировой войны камикадзе Коити Сикисима приземлился на острове Одо, где находилась ремонтная база японской императорской армии. В тот же вечер на них напал огромный ящер Годзилла, который неожиданно появился и был известен местным жителям под этим именем Коити возвращается в Токио, разрушенный бомбардировками (его родители погибли, а дом был уничтожен).
Он пытается начать новую жизнь. К нему присоединяется девушка, которая также потеряла свою семью, и у неё на руках остался младенец, спасённый ею во время воздушного налёта. Время идёт, жизнь постепенно налаживается, Коити работает в команде по разминированию Токийского залива. Однажды их хрупкий деревянный катер сталкивается с Годзиллой, который после ядерных испытаний на атолле Бикини стал ещё больше и свирепее.
